Obor: Biologie

Segmentace biologických 2D objektů

Navrhovaná práce se zaměřuje na rozvoj metod počítačového vidění s důrazem na segmentaci objektů ve 2D datech. Ve spolupráci s mikrobiology budou analyzována data s konkrétními úlohami. Součástí studie bude výběr vhodných metrik pro porovnání účinnosti různých segmentačních metod. Na základě těchto srovnání bude navržen systém schopný sledovat proces změn v čase. https://www.utia.cas.cz/cs

Efektivní strategie pro produkci rekombinantní 2Apro enterovirů (A71 a D68) pro následný návrh inhibitorů proteáz.

Enteroviry (EVs) jsou jednovláknové RNA viry s pozitivní polaritou, jejichž zástupci způsobují rozšířená onemocnění s významnými zdravotními a ekonomickými dopady, které se běžně vyskytují u malých dětí i dospělých. Jsou nejčastějšími původci virových respiračních a neurologických infekcí, obvykle způsobují mírné příznaky, ale jsou schopny vyvolat závažné problémy, včetně akutních záchvatů astmatu, akutní paralýzy a myokarditidy.…

Funkční nanovrstvy pro reálný svět

Student se během své stáže seznámí s postupy přípravy, charakterizace a aplikace funkčních nanovrstev s tzv. antifoulingovými vlastnostmi, které mohou mít široké uplatnění pro reálný svět. Naučí se např. i metody postmodifikace polymerních vrstev s cílem ukotvit bioreceptory k povrchu při dosažení cílených funkčních vlastností povrchu. Procesy funkcionalizace bude kontrolovat pomocí optických metod (např. surface plasmon resonance…

Využití imobilizovaných faktorů pro diferenciaci primárních osteoblastů

Tkáňové kultury jsou bodem výzkumu v různých oblastech biologie, chemie, imunologie a medicíny. Obvykle se používají takzvané imortalizované kultury, tj. kultury buněk, které se mohou neomezeně množit, ale jsou určitým způsobem modifikované a proto se liší od buněk ve skutečných tkáních – například různé rakovinné buňky. V poslední době se stále častěji používají takzvané primární…

Detekce patogenů nebo protilátek proti patogenům pomocí série LSPR aktivních nanokompozitů

Cílem této práce je podílet se na vývoji nového detekčního systému nejen vybraných bakterií a virů, ale i jejich proteinů a protilátek proti nim. Detekční systém je založen na principu fyzikálního jevu LSPR (lokalizované povrchové plazmonické rezonanci), kdy po navázání patogena/proteinu/protilátky na LSPR senzor obsahující kovové nanočástice (stříbro, měď…) dojde ke změně optických a elektrických…

Pohled do srdce afinitních biosenzorů aneb vývoj biočipů na míru

Student se v rámci této stáže nejprve seznámí se základními principy moderních afinitních optických a piezoelektrických biosenzorů, které zacilují na analýzy reálných, tudíž komplexních biologických vzorků, se zaměřením na oblasti bezpečnosti obyvatel, klinické diagnostiky a bezpečnosti potravin. V rámci této stáže si student osvojí měření metodami surface plasmon resonance (SPR) a quartz crystal microbalance (QCM). Seznámí se…